La parroquia Santa Elena se encuentra ubicada en la región norte de la Amazonía ecuatoriana, en la provincia de Sucumbíos, cantón Putumayo. Forma parte de la Circunscripción Territorial Especial Amazónica y se localiza en la cuenca alta del río Amazonas, una de las regiones con mayor biodiversidad del planeta.
Su territorio abarca una extensión aproximada de 54.592,72 hectáreas, caracterizado por una riqueza natural excepcional, diversidad de ecosistemas y una importante presencia de comunidades rurales.
Santa Elena es una parroquia de tipo rural conformada por 20 comunidades, con una población distribuida de manera dispersa en el territorio.